A Chapecoense inicia a sua trajetória no Campeonato Brasileiro Sub-17 2021 fora de casa. A equipe estreia contra o Sport, no dia 10 de abril, com mando de campo pertencente ao time pernambucano. O primeiro jogo da equipe catarinense dentro de casa será contra o Vasco no dia 17 de abril.
A Chapecoense participa do grupo B da competição nacional, juntamente com Corinthians, Internacional, Fluminense, Fortaleza, Sport, Vasco, Atlético-MG, Athletico Paranaense e Santos.
A primeira fase se encerra em junho e as finais estão programadas para ocorrer nos dias 10 e 17 de julho.